Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L8P0C7I0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L8P0C7I0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms