Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC1P02654 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms