Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TSPAN13O95857 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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