Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms