Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD4O60885 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD4O60885 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD4O60885 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD4O60885 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRD4O60885 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
BRD4O60885 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms