Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms