Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms