Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E9PBE3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E9PBE3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E9PBE3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E9PBE3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
E9PBE3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E9PBE3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E9PBE3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms