Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms