Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms