Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms