Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD2Q9NZN4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD2Q9NZN4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD2Q9NZN4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD2Q9NZN4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD2Q9NZN4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms