Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms