Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms