Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYLDQ9NQC7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYLDQ9NQC7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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