Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms