Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRAGCQ9HB90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRAGCQ9HB90 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms