Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF1Q9H7N4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF1Q9H7N4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms