Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP6Q9GZR1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms