Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms