Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMBRA1Q9C0C7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms