Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUS3Q9BZE2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms