Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARP6Q9BRS8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms