Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms