Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPA33Q99795 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPA33Q99795 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms