Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GAD1Q99259 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms