Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED4Q96RK1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms