Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP4Q96PP9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms