Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDLIM2Q96JY6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms