Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms