Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTP4Q96DX8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms