Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL4Q96C24 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL4Q96C24 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms