Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC8Q96B26 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms