Protein–RNA interactions for Protein: Q969L4

LSM10, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM10Q969L4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSM10Q969L4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms