Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms