Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD54Q6NXT1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms