Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms