Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM78BQ5VT40 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms