Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms