Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms