Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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