Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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