Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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