Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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