Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms