Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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