Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMC1AQ14683 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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