Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms