Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASGRF1Q13972 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms