Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FHL3Q13643 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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